Två unga killar tvingas ta två helt olika banor i karriären. Smågangstern Ming skickas av sin triadledare för att börja som poliskadett och infiltrera poliskåren som mullvad. Samtidigt har den unge polisen Yan fått i uppdrag att gå undercover hos samme triadledare.

När båda sidor inser att de har mullvadar bland de sina dras de båda in i ett komplicerat spel om vem som ska avslöja den andre först. Infernal Affairs är den hårdkokta actionthrillern som låg till grund för Martin Scorseses The Departed.